以古装、神话、传奇为主的单元剧《台湾奇案》分171个单元，共432集，剧情多改编自闽台地区民间传说与庙宇故事， 由郭美珠主持，1999年3月6日开拍，同年5月19日在台湾省民视首播。
苗翠花（关咏荷 饰）到广州探望父亲，生性好强的她与当地首富方德（江华 饰）多次结怨。翠花误伤了漕督大人的儿子，使之变成了白痴。愤怒的漕督扬言要找翠花报仇，与翠花父亲甚有交情的方德出面相救，冒险认了翠花是自己的四姨太，以方德与恭亲王的交情保住了翠花的性命。 而翠花更将错就错嫁入了方家，引起了方家妻妾的不满，翠花更多次违反方家的家规，与方德的冲突不断。但在往后的日子里，两人共同面对了许多的患难，当二人情愫渐生的时候，方德因为帮助反清义士而被捕了……
佩佩（陈秀雯 饰）自从婚后就尽心尽力当一名合格的全职主妇，相夫教子。这些年来和丈夫阿礼（姜大卫 饰）一直相敬如宾，一对子女亦聪明伶俐，可以说是外人眼中的模范家庭。然而，佩佩这些年来忙于照顾家庭，却一直忽略了自身的修饰和提高，导致阿礼面对佩佩时感到十分无味。一次，阿礼邂逅 了美艳女星卓羚，开始了一段婚外情。阿礼越陷越深，最终决定和佩佩离婚。直到这时，佩佩才知道这一残酷的现实。这一打击令她十分消沉，失去了家庭令似乎她失去了所有的依傍，幸亏这时好友汤敏蓉（邓萃雯 饰）及洪世亮（林伟 饰）不断鼓励和开解她，她才慢慢的振作起来。 在好友的帮忙下，佩佩逐渐走出婚姻失败的阴影，她亦开始接受了这次失败的教训，努力改造和提升自己。经过一番努力，佩佩顿时变得明艳动人，更与英俊潇洒的医生子儒（陈启泰 饰）打得火热。另一方面，阿礼与卓羚激情消退后，又开始想念以前那温馨的家了……
工作失意的广告公司创意总监朱欣葵（邵雨薇 饰）竟意外成为寿山动物园实习保育员，与王柏杰共谱浪漫职场故事。
一个以CID为故事主干线的剧集，对剧中警探除工作外的个人性格均有深刻描述，主角人物童芷珊在工作、家庭、爱情三方面的剧情更具吸引力。
鱼至嚣（谢天华 饰）和鱼至赢（张智霖 饰）是同父异母的兄弟俩，和至赢的母亲江映月（吕有惠 饰）一起守着父亲——香港著名的饮食大亨，留下的日本寿司店“月泷纱”。至嚣的目标是成为顶级的寿司大师，一直在不断磨练自己的技艺，和至赢母子俩也相处的很融洽。平静的生活被父亲的原配夫人冷雍容（卢婉茵 饰）所打乱。遭到其打击的至嚣以月泷纱的名号向冷雍容发起挑战，有备而来的冷雍容利用其看护人赛思茏（杨怡 饰）作梗，思茏和至嚣也发生了一段似真似假的爱情，得知真相的至嚣颇为消沉。 另一边，至赢在去北海道寻找货源的飞机上邂逅了麻烦的千金小姐姜羌（胡杏儿 饰），二人在菜市场偶然遇到了号称“百目鱼神”的高手慕容澄（刘松仁 饰），而至赢的料理才能也被逐渐开发出来。在事业、爱情、家庭连遭冲击下，最终迎来的是兄弟二人的一决高下……
周伟光（陈庭威 饰）自幼便失去了父母，在孤儿院中长大，孤儿院里，周伟光遇见了同样身世伶仃的郭兆中（莫家尧 饰），两人之间结下了深厚的友谊。周伟光生来拥有能够放电的特异功能，但是因为这异于常人之处，周伟光常常遭人嘲笑和歧视。 之后，周伟光和郭兆中邂逅了名为关子菁（关咏荷 饰）的女孩，关子菁拥有预知未来的能力，她预感到在周伟光和郭兆中之间，有一个人会成为自己日后的人生伴侣。于是，关子菁将两个男人召集起来，开了一家专门帮人解决疑难杂事的万能公司，想要利用他们的特异功能赚得盆满钵满，哪知道公司刚开没多久就遭遇了滑铁卢。
许忠信（万梓良）及其任职投资主任的妻子洛素珊（林其欣），本过着安稳的生活，但面对九七问题，忠信无奈接受妻子的安排，独自到澳洲当“太空人”，途中认识大陆青年游向东（吴镇宇），两人在彼邦人地生疏，受尽欺凌，患难中成莫逆之交，后因移民局查破实情，向东被押回港，而忠信有感夫妻分隔多时，决意回港，惜此时素珊正与前度男友侯世杰（张兆辉）旧情复炽；向东为好友不忿，集众羞辱世杰，世杰以为忠信主使，誓要雪此辱。 安靖（周海媚）因妹安琪（余倩雯）与忠信之弟忠诚（李中宁）的纠纷而认识，工作上两人再相遇，接触日多，但于双方感情上的阴影，只维持朋友关系。 另一方面，向东的年轻表姨妈谢西西（梅小惠）回港欲物色对象，向东为取绿咭欺骗西西感情，欢喜冤家搞出笑话连篇。 信之妹夫兆坤生意失败，骗忠信将保险金加股，再卷款私逃，信幸得众人协助面度过难关，忠信与安靖的感情更进一步。 世杰信成就，竟勾结兆坤回港与忠信争夺股权，又同集团太子爷子谦献（欧阳震华）计收购忠信的事业，忠信反得集团主席宋棠（鲍方）赏识，至欲招为女婿，更加引来世杰的嫉妒，势成水火；此时，忠信与安靖的感情亦因子君（朱洁仪）的出现而趋白热化……
故事开始时，将届30岁的方佳莹， 被迫，展开了这场“一个人”的幸福冒险。 故事结束时，佳莹经历了“一个人→两个人→再度一个人”的一年， 她终于懂了，她仍然需要爱情、朋友和家人， 只不过所有的他们，并不会时时刻刻、理所当然陪着你， 他们总有一天会不在你身边， 面对这样的现实，在最需要温暖和帮助的时候， 你要让“自己”成为最厉害的备胎。 “学会不孤单、也不要让自己寂寞，那些都是因为缺乏所带来的情绪。”
清朝末年，留洋归国的富家子弟林继民（于洋 饰）被家乡广州城内民不聊生的社会景象激发出救国情怀，联手青年革命志士陈镜波（林锦堂 饰）合办报纸欲启发民智，却因揭发清政府的腐败屡遭官方打压致报馆被查封，继民备受打击从而立志加入同盟会，抛下了新婚妻子蔡雪雁（李司棋 饰），赴港追随黄兴（秦煌 饰）投身革命。雪雁本是镜波的未婚妻，为了保障雪雁的安稳，镜波忍痛将雪雁托付于家境优渥的继民，不料雪雁一过门便独守空闺，又因小姑林芷珊（韩马利 饰）情系镜波而遭妒忌，在继民出走后遭到夫家的欺侮，无奈走上了革命的道路……
陈大虾（林文龙 饰）从小就是去了父母，是无依无靠的孤儿，以卖糖水为业，勉强能够糊口。某日，陈大虾偶然遇见了名为季巧儿（郭可盈 饰）的富家千金小姐，美丽端庄的季巧儿吸引了陈大虾的注意，使他坠入情网，然而，陈大虾深知他们两人几乎是两个世界的人，不会有任何交集，于是选择将这份感情埋藏在心底。 一次偶然中，陈大虾意外获得了十颗神秘的晶石，而季巧儿又在误打误撞之中吞下了它们，令两人没有想到的是，尚未出阁的季巧儿竟然怀孕了，闹得季家上下鸡犬不宁。十个月后，季巧儿竟然诞下了十个孩子，令陈大虾深感不妙，然而，陈大虾还是不离不弃的陪伴在母子十一人的身旁。
户部郎中齐学仁为官刚正不阿、一直不肯同流合污，幕后黑手连同他的上司户部侍郎柴毅一起栽赃嫁祸，令到银库里巨额白银不已而非，齐家一家被收监问斩。幸好义仆舍身从监房里换出了学仁的儿子齐百川（陈豪 饰），齐家才保留了一点血脉。目睹了家人和义仆被当众抄斩，百川悲愤不已。随后他流落街头、万念俱灰，一次偶然机会被当地最大的票号鼎丰盛东主乔本业（姜大卫 饰）看中，招入了鼎丰盛当学徒。进入鼎丰盛让百川看到了一个彻查全家被斩的冤案的机会，他化名子齐，一方面努力学习票号业务，一方面努力往上爬，为的就是有朝一日能借助鼎丰盛为全家翻案。另一方面，票号的大掌柜曹裕泰（刘丹 饰）一直想当上鼎丰盛的东主，连合鼎丰盛全国各分号的老帮逼宫，后被乔本业化解危机，不甘心的曹裕泰离开了鼎丰盛另立炉灶对抗鼎丰盛。乔本业一次偶然救了来自塞外的巴巴哈儿高娃（郭羡妮 饰）姐弟，两人随后也留在了鼎丰盛工作。子齐与高娃在朝夕相处中互生爱慕，但身负复仇使命的子齐知道自己可能会连累高娃，于是选择了独自承担……
年轻的空军飞官孙天翔，英俊挺拔，爱打抱不平，偶然中结识在脚踏车店中的学徒林 文雄，俩人颇为投契，进而结拜为兄弟。小镇的美女老师周玉梅在一次的修车机会中，认 识了也登门修车的孙天翔 ，俩人相互吸引，并且很快的产生热恋，然而这段恋情并不被 众人所祝福，玉梅的母亲在一次意外车祸中被军人撞成瘫痪，令周父对军人痛之入骨，再 加上省籍的偏见，百般阻饶玉梅和孙天翔的交往。活泼的眷村女孩何嘉琪，暗恋天翔多年 ，见对方竟然选择玉梅，忌妒之余，编织某些谎言让玉梅对天翔产生误会，经营米厂的周 父由于米厂生意经营不善，暗中接受苏添财父亲的金钱周转，意将玉梅下嫁添财，然而情 路的坎坷，只是更加坚定俩人对彼此的爱情。 勤奋好学的文雄，心中亦对玉梅存有爱意，却因对天翔的敬重，只能将情感暗藏心底 ，并不时提供机会，促进他们俩人约会。被调职到花莲基地的天翔，临别之际，将玉梅交 托文雄以及同袍好友常伯群照顾，而嘉琪也在常伯群的追求下，成为一对。 在周父的强力干扰做主的情形下，玉梅被迫下嫁苏添财，为了当初对兄弟的承诺，文 雄在婚礼上将玉梅偷偷接走，历经波折辗转找到天翔，久别重逢的天翔和玉梅，相见恍如 隔世，俩人决议私订终生，然而好景不常，在嘉琪和常伯群的婚宴上，突然接获孙天翔在 任务中失事，不幸身亡，消息传来，玉梅痛不欲生，偏偏此时她又怀孕，在当时的民风下 ，未婚生子将招致非议唾弃，文雄为保护玉梅，决定娶玉梅为妻，而两人只是维持著名义 上的夫妻关系。为遵守对天翔的承诺，文雄一方面对玉梅悉心照料，一方面亦不放弃任何 希望的打听天翔的下落。 在文雄的照顾之下，玉梅顺利产下一子，为感激文雄所做的一切努力与牺牲，在儿子 天浩满月之后，她主动与文雄成为真正的夫妻， 而文雄也在玉梅的辅助下，专心发展事?业，逐渐有成。 时光流逝，转眼之间，文雄的三个孩子天浩、弘伟、弘雯都已长大成人，天浩与何嘉?琪的女儿常欣欣相恋，而欣欣偏又是弘伟追求的对象，三人之间因而不时产生紧张关系， 弘雯认识一心想考空官的苏克文，而苏克文的父亲竟是苏添财，添财在知道弘雯是玉梅的 女儿后，新仇旧恨全部涌现，坚决反对俩人来往。 在一次的大陆旅行中，常伯群和何嘉琪巧遇当年失事被掳的孙天翔，老友相见恍若隔 世，在常伯群百般奔走后，孙天翔回到台湾，这将会为玉梅和文雄带来什么样的冲击？天 浩的身世会否被揭开？弘雯和克文这对小情人，能否在上一代的恩怨纠葛中，寻到属于彼 此的幸福？天浩和欣欣的恋情在弘伟的介入下，能否有情人终成眷属？面对 分离二十载?，情所深系的昔日恋人孙天翔以及风雨中一路相伴扶持的枕边人林文雄，玉梅又该如何来 抉择、、、、
