天侑六年，志宗崩逝，其次女公主楚九龄（彭小苒 饰）质疑其叔父弑君篡位。经历家破人亡等一系列突如其来的变故，九龄下定决心查清泽州隐秘，揭穿父皇被害真相，守护自己的至亲。九龄在成国公世子朱瓒（金瀚 饰）的帮助下坚持济世救人，不断地与奸佞的骚扰和攻击斗争，建立了医馆九龄堂，治痘疮，护百姓。与此同时，朱瓒与清贵公子宁云钊、前夫陆云旗、方家独子方承宇，身份各异、关系复杂的四人，陷入了以九龄为核心的感情漩涡。谁才是九龄的真命天子？命运齿轮，缓缓运转。
百集故事，说不完的世事沧桑，道不尽的韵味悠长，三代人命运曲折，四家人情爱跌宕，收视率在当时曾经一度居高不下。 改革大潮席卷，商场争斗无情。 人生步履坎坷 真情挚爱温馨，一部展现五个不同家庭不同人物不同事业的沉浮和感情纠葛的优秀电视剧。 一条翰英街，说不完的世事沧桑，一个好故事 说不尽的韵味悠长，百集故事，折射改革开放都市巨变俊男靓女，呈现京城精英众生相。 翰英街上，楚、叶、林、柯、刘五家勾起了许多故事，记叙了五家的悲欢离合。 痴情的张薇深得周建国的信赖。叶新元邂逅孔繁苓，勾起了他们十几年前的一段未了的恩怨。林飞自美国回来，兄妹俩喜得相见。柯永年私情败露，刘华英爱恨难舍。楚天舒烧毁了能证明他是W40发明人的唯一证据。刘德林引来卖店风波，刘二爷，刘华英啼笑皆非。叶小桐毛遂自荐，孙繁苓虽喜犹疑。郑兴旺嘲讽张薇，叶小桐申明事理。叶新元借机还情，小情人生疑反目。林五淑故里重游，叶公子投石问路。楚天舒督陈高考，俏小月另辟蹊径。叶小桐穷追税款，周经理愤而离职。小芳、杨平见义勇为，憨汉德林浪子回头，柯永年撰文鸣不平，陈家明、江萍萍刮目相看……
该剧以知名法医王雪梅的工作经历为蓝本进行改编，讲述了 一个由挑剔组长尚桀、专注专业的女法医夏萤、万金油痕迹鉴定员李学凯，天然呆信息分析员宋咪，以及富二代心理侧写师英鸣组成的非常规特案组，集齐了局里各种“不靠谱”的人，通过通力合作，他们相继破获了各种离奇的凶杀案，一出手就抓住了逃窜了三四个城市，以制造意外为杀人手段，穷凶极恶的连环杀手，一战成名，特案组之后又接连破获了南山公园的碎尸案，离奇的灭门惨案以及抓获反侦查意识极强的兄弟杀手。
2002年初夏，一个针对中国皇陵的国际走私恐怖行动秘密展开，正邪交锋，集团副首脑美奈子落入我公安部反劫持小组徐枫(王诗槐饰)手中，数月后，首脑申克用重型武装劫持了中国开往莫斯科的东方国际列车，数百中外旅客成为人质。多方交涉未果，反劫持负责人宇文长延(石凉饰)开始营救，可几名突击队员被杀，部分人质被申克杀死，不得不释放美奈子并将1500万赎金交给了潜伏多时的恐怖分子朱立安(徐锦江饰)。赎金到手，一个策划已久的恐怖计划又展开，安准备将申克连同整列列车一并炸毁，唯一的知情者竟是徐枫妻子苏颖(王姬饰)，当警方获悉这一情报，最后的营救机会已失去……
离开教育行业三年的郝楠（郭京飞 饰），在经营店铺失败后，重回教师岗位。十八岁的任真（任敏 饰）因不靠谱的父亲导致高考落榜，在天台遇到了同样失意的郝楠，然而郝楠却用自己的亲身经历鼓励了任真。巧合的是，成为青云中学高三14班班主任的郝楠与新入班的任真再度相遇。在随后备战高考 的日子里，郝楠与班里的学生从互相不理解到惺惺相惜，在他的努力下，这群憧憬未来的少年逐渐敞开心扉，开始信任这位特殊的老师。郝楠了解到每个学生的梦想和想要实现的人生价值，他如同麦田里的守望者，守护着一个个心怀梦想的少年，让他们积极为未来奋战，以饱满的状态应对高考，迎接各自的灿烂人生。
1937年，卢沟桥事变，抗日战争全面爆发。方振东与万子卿都参加了北平守军的学兵团。血战中，俩人成为挚友，并同时爱上了潼关杜家的大小姐杜兰云。然而方、万两家却交恶数百年。大敌当前，方振东，万子卿努力化解两家恩怨，共同抗日。日军兵抵潼关，杜兰云为救方振东，谎称自己怀了方振东的孩子并决心嫁给方振东。之后在与日军的一场血战中，万子卿只身归来，方振东“战死疆场”。此时杜兰云已经怀了方振东的孩子。万子卿得知后，主动表示愿意做这个孩子的父亲。就在二人预备重结连理时，却赫然发现方振东并没有死。最终，民族大义化解了爱恨恩怨。
程雪逸被确诊为脑癌晚期，她因此与外遇不断的丈夫离婚，并带着5岁的儿子星宅离开北京去厦门，想把他交给他的亲生父亲--前男友韩若定。而此时韩若定婚姻很幸福。韩若定虽然很震惊，但是依然接受了儿子。但是为了不让怀孕的妻子莫荔受到影响，他决定暂时不跟她说明真相。一个月后程雪逸重新爱上了韩若定，将医院误诊的事情隐瞒下来。虽然程雪逸采取了一系列过激的行动，但韩始终不为所动。程破产，试图自杀之际，莫荔冒险将其救下。韩若定和莫荔帮助程雪逸摆脱往日困扰，重新振作。程雪逸认识到自己的错误，选择离开。莫荔的咖啡馆顺利开张，韩若定尊重星宅的决定把他送回了北京。
八十年代梁鼎文（任达华饰）接过父亲梁恒（李立群饰）经营的梁记饼店，父亲梁恒和儿子梁家栋（冉旭饰）突发重病，台风灾难接踵而至，弟弟又惹下大祸，妻子宋曼琴（江珊饰）穷极无路，将梁家大屋卖给了觊觎大屋的苏耀庭。梁鼎文大怒将宋曼琴逐出家门，认为其受了苏耀庭之子苏林的蛊惑，宋曼琴悲恨离开。多年后苏耀庭离世，苏林与宋曼琴回到澳门，宋曼琴和梁鼎文因孩子抚养权的问题再生间隙。随着1999年澳门回归，梁鼎文带领一家人历经磨难，日子步入正轨。几年后梁舒（董洁饰）、梁家栋、陈小帅（董晨饰）这几个孩子都已长大成人，大陆建筑设计师文扬（邓飞饰 ）因工作原因寄宿到梁家，文扬与梁舒暗生情愫。梁记出现竞争对手，梁舒助梁记渡过了难关。大澳集团突遇破产危机，苏家梁家为此四处奔波，两家终于冰释前嫌，苏林也归还了梁家大屋房契。台风的到来让梁鼎文与韩雅琪（柯蓝饰）患难见真情，终于喜结连理。转眼间澳门迎来了回归二十周年，梁舒文扬同年举办婚礼。
故事发生在民国年间。佩珊（郭珍霓 饰）是洪家的童养媳，小小年纪便来到洪家，过着寄人篱下的生活，受尽了旁人的白眼和欺凌。唯一对她好的，只有洪家的养子振刚（陈冠霖 饰），两颗孤独的心渐渐靠近彼此温暖，随即产生了真挚的感情。然而，按照规定，佩珊必须嫁给家宝为妻，倔强的佩珊宁愿谎称自己已经怀孕也不愿意成为不爱的男人的妻子。 愤怒的洪夫人想要按照家法处死佩珊，逼得振刚挺身而出带着佩珊踏上了私奔的旅途。一直暗恋着振刚的佩琦（符馨尹 饰）为此伤心不已。一场意外让城里开始流传起了关于佩琦的风言风语，一时之间佩琦成为了烫手的山芋。善良的王凯诚（贺刚 饰）答应迎娶佩琦。
白皓宇（盛一伦 饰）出国念书归来，想要见一见自己曾经的青梅竹马慧珍（迪丽热巴 饰）。曾经，慧珍是前途无量的美少女，但如今，她不过是一介毫不起眼的超市理货员。为了不让白皓宇失望，慧珍找到了自己的白富美闺蜜夏乔（李溪芮 饰），求她假扮自己去和白皓宇见面，哪知道夏乔假戏真做，对白皓宇动了芳心。 慧珍找到了一份杂志社的新工作，让她没有想到的是，自己的上司竟然正是白皓宇，一开始，白皓宇十分看不上大大咧咧傻里傻气的慧珍，但随着时间的推移，白皓宇渐渐在慧珍身上看到了过去的影子，对夏乔和慧珍的真实身份产生了怀疑。与此同时，记者林一木（张彬彬 饰）亦对慧珍展开了热烈的追求。
赛小花（李晟 饰）毕业之后孤身一人千里迢迢的来到了繁华的首都北京，想要在这里闯出一片属于她的天地。然而因为陷入了和上司乔马（立威廉 饰）的不伦之恋中，好不容易找到了工作的赛小花惨遭辞退。 之后，赛小花结识了尤亮（魏千翔 饰）、张宏（郭家豪 饰）、梁艳丽（陆媛媛 饰）等年轻人，几人一拍即合，决定创业，开始创立经营一家专营有机蔬菜的超市。在此过程中，赛小花和尤亮渐渐走到了一起，然而这段感情却因为残酷的现实而最终破裂。失意的赛小花邂逅了名为谢易光（涂松岩 饰）的男子，后者的温柔体贴让赛小花在此感受到了被爱的感觉。
何之洲（佟梦实 饰）为了救沈熹（宋芸烨 饰）不幸在一场事故中身受重伤，性命危在旦夕。沈熹意外的发现了能够将她带回过去的镜子碎片，于是她来到了何之洲受伤之前的那个节骨眼上，这一次，沈熹做出了和曾经不一样的选择，两人终于走到了一起。可是，不管沈熹怎样的努力，还是无法避免意外的发生，当时间又跳跃到两年之后时，沈熹发现此时他们的境遇竟然还不比从前。 一次次的尝试，一次次的改变，沈熹孤独的同命运做着斗争，却依旧什么都无法改变，最终，沈熹发现自己的无数次失败原来是有人在暗中破坏，而他究竟和何之洲有着怎样的深仇大恨，以至于要一次次的置他于死地而后快？
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
