ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
一天，大雄和静儿、技安被强夫邀到家中参观恐龙化石。当然，大雄免不了又被强夫取笑一番。为了要做强夫面前争一口气，大雄夸下海口，恐龙化石没什么了不起，他要让小伙伴们见识一下真正的恐龙！ 奇迹再次发生在大雄身上，他真的找到了一颗活的恐龙蛋！大雄和叮当在家将小恐龙孵化了出来并在公园里暗中饲养。小恐龙比助一天天长大，公园有怪兽的消息传遍了日本。为了小恐龙能健康成长，大家决定将小恐龙用时光机送回白垩纪。 没料到，一个神秘人暗中跟踪他们，也来到了白垩纪想要虏走比助。为了保护比助，叮当、大雄、强夫、技安和静儿再次来到了白垩纪……
有一天，太阳的恩惠，也就是光变得微弱下来了，这可是大事件，这样下去，不可思议星将没有光，成为黑暗的世界！根据传说，为了让太阳的恩惠回到世界，需要只有太阳之国的公主才可以使用的魔法“prominence”。但是，能够拯救星球那样强力的prominence只有一名合格的公主才能够发动。
“由于遗传基因科学的进步，人类正急剧变身”（史蒂芬·W·何金） 舞台设在公元2007年的皇树学院都市。这里是汇集最新科技的研究学院都市。 这当中，有个为培养各领域的专家而设立的皇树学院。能进入这个学院的人，一定在某个领域里拥有杰出能力。 有一天，这个皇树学院的高中部里，来了名叫浩司、龙还有迦瓦鲁的三个人。那天开始，平静的学院生活蒙上了阴影，激烈的战斗开始了。 袭击他们的异型以及迎击的白色身影，被称作生化体的他们拥有远超人类的速度与力量。 迦瓦鲁、浩司、龙，他们到底是什么人！？而他们的目的又是？还有，袭击他们的生化体以及生化体背后的神秘组织是……！？ 人类在探索新的可能性的同时，也会有新的威胁产生的可能性，这就是生体细胞强化理论。三个年轻人面对的，就是为了这个理论的完成和实现而暗中活跃的强大组织。 但是，他们剩下的时间，只有三个月了！ 由于遗传基因科学的进步，人类正急剧变身”（史蒂芬·W·何金）舞台设在公元2007年的皇树学院都市。这里是汇集最新科技的研究学院都市。这当中，有个为培养各领域的专家而设立的皇树学院。能进入这个学院的人，一定在某个领域里拥有杰出能力。有一天，这个皇树学院的高中部里，来了名叫浩司、龙还有迦瓦鲁的三个人。那天开始，平静的学院生活蒙上了阴影，激烈的战斗开始了。袭击他们的异型以及迎击的白色身影，被称作生化体的他们拥有远超人类的速度与力量。迦瓦鲁、浩司、龙，他们到底是什么人！？而他们的目的又是？还有，袭击他们的生化体以及生化体背后的神秘组织是……！？人类在探索新的可能性的同时，也会有新的威胁产生的可能性，这就是生体细胞强化理论。三个年轻人面对的，就是为了这个理论的完成和实现而暗中活跃的强大组织。
故事将与游戏内Shuffle活动展开联动，包含「桃源乡偶像拳」、「真夜中のBUTLERS」与「La Mort」。 由于Esemble Square推出过多部偶像电影，偶像们动身前往纽约，准备参加偶像电影祭典「IDOL FILM FESTIVAL」的颁奖典礼，然而怪异的影子却悄悄向他们逼近。
强烈的台风登陆日本，风雨过后，大雄遇到了一个捣蛋的小家伙。通过未来机器的检测，发现这竟是拥有智慧的小型台风，大雄为它起了一个可爱的名字——小风。为了让小风自由玩耍，大雄、哆啦A梦和静香带着小风来到一片神奇的土地。他们在此认识了御风而行的天吉和小纯，得知自己来到了风的部落，小伙伴们与这里的人很快成为朋友。 但是，风之部落的和平正受到邪恶的威胁。无恶不作的岚族人揭开了族长乌岚达的封印，他的灵魂附在小夫的身上，率领其族人企图统治整个世界……
全新的“赛亚人”故事。力量大会后，悟空了解到宇宙中还存在着自己未曾见过的 强者。某天，现身于悟空和贝吉达面前的是从未见过的赛 亚人布罗利。三个走上完全不同道路的赛亚人，为集齐七 龙珠意外相遇，从地狱中再度归来的弗利萨也被卷入其中， 地球将爆发一场壮烈战斗……
冬空凩（小野友树 配音）自幼就有着比一般人强烈的灵感力，常常会遭到幽灵的附身，人生因此一直都不是很顺利，甚至因此而背负上了巨额的债务。无奈之下，冬空凩只得到处寻找容身之处，就这样来到了名为摇曳庄的温泉旅馆之中。 虽然摇曳庄的所有住客都是女性，但冬空凩最终还是在这里找到了落脚之地。天真可爱的地缚灵汤之花幽奈（岛袋美由利 配音）、每天都沉浸在妄想之中的美少女偶像宫崎千纱希（铃木绘理 配音）、对妖怪感到深恶痛绝的灵能忍者高桥李依（高桥李依 配音）、酒吞童子的后裔荒霸吐吞子（加隈亚衣 配音），和冬空凩住在同一屋檐下的是这些奇奇怪怪的美少女们。
月岛星璃（久住小春 配音）是一个活泼可爱整天没心没肺的女孩，一次偶然中，星璃在救一只小乌龟的时候不慎从树上掉了下来，并被一个神秘而又英俊的男人给接住了，这个男人名叫日渡星司（陶山章央 配音），而星璃所救的小乌龟正是他的宠物。为了报答星璃，星司给了星璃一张演唱会的入场券，深深的被星司的温柔和帅气所吸引的星璃在演出当天来到了会场，却在误打误撞之中进入了后台，遇见了个性粗暴傲娇的风真宙人。 原来，星司和宙人正是当红偶像团体SHIPS的两名成员，而星璃也在机缘巧合之下许下了想要成为偶像的承诺。
作为“战争机器”长大的女主人公薇尔莉特·伊芙加登，在战争中失去双臂，并与收养她的少佐分离，在装上义肢后，成为邮政公司一名从事代写书信工作的 “自动手记人偶”。在车马缓慢、只能以信件传递感情的年代里，“自动手记人偶”通过与委托人接触交流，代写书信，以优美准确的文字传递着人们最为真挚的感情。外传的故事中，薇尔莉特·伊芙加登接到了一桩特殊的委托工作……
被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”，并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。然后，是各式各样把迷惑与决意藏于胸口，前进开拓着未来的人们。把互相重合的中世纪世界作为舞台，学生们在学园国家间的抗争正式上演了！
小维（广桥凉 配音）是一名标准的“电波少女”，表面上，她常常面无表情、一动不动，似乎无论这个世界发生了什么都跟她没有任何关系，但在内心里，有些孤独的小维还是希望能够得到他人的关心和友谊。 一次偶然中，一位名叫银仙（小野大辅 配音）的狐仙来到了小维的身边，由于担心小维的生活和健康状态，善良的银仙主动留在了小维身边，陪伴并照顾着她。之后，表面腹黑内心忠诚的狗神（樱井孝宏 配音）、放荡不羁的信乐（中田让治 配音）、傲娇的小玉（野上尤加奈 配音）接二连三的出现在了小维的面前，有了这些古怪但善良的朋友们陪伴，小维的生活中会发生怎样有趣的故事呢？
