《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
公元710年，李旦的三子李隆基（刘威 饰）发动政变帮助他取得了皇位，事隔两年之后父亲把王位禅让给了儿子。李隆基登上皇位成了唐玄宗，大唐又迎来了盛世的发展。若干年后平静被皇子李瑁（黄小雷 饰）的妃子杨玉环（林芳兵 饰）打破，李隆基看上了她，在亲信宦官高力士（李如平 饰）的 帮助下，他不顾一切得到了佳人，杨玉环从此成为了杨贵妃。尽管已经有了武惠妃（李建群 饰）、王皇后（李静莉 饰）、赵丽妃（周洁 饰），但是唐玄宗最爱的还是杨贵妃，甚至把杨玉环的堂兄杨国忠（高兰村 饰）变成了丞相，两人一起度过了好些年快乐的生活，直至安禄山（颜彼得 饰）的叛乱出现。最终杨玉环还是成了政治的牺牲品，惨死在马嵬坡，而命运对唐玄宗的眷顾就此为止。
丁爱羽（许晴 饰）年轻漂亮事业有为，只可惜在爱情上总是不如意，屡屡背负上“小三”的骂名。方可舟（梅婷 饰）表面上拥有一个幸福的家庭，然而实际上，她和丈夫罗建军（高曙光 饰）之间的关系早已经跌入了冰点，无论是灵魂还是肉体，两人都毫无交集。 早年的艰难经历让谢香枚（柯蓝 饰）的个性变得坚韧而又不驯，这也是男人们对她退避三舍的主要原因。谢香枚早已经习惯了用冰冷的外表武装柔弱的内心，没有人能够看到他真实的面貌，直到有一天，一个名叫林丹青（耿乐 饰）的男人出现在了他的面前。起先，谢香枚和林丹青相互看彼此不顺眼，然而，随着时间的推移，两颗孤独的心渐渐靠近。
10岁的女孩汪雨强烈抵制继母向雨桐的加入，但最终向雨桐携12岁儿子李慕居和表弟江之冰入住汪家。父亲对小汪雨的忽略使得她对继母更加的抵触。江之冰的关爱使汪雨倍感温暖，并对冰叔叔产生了朦胧爱意。江之冰出国留学了，再无希望的汪雨为了报复父亲而离家出走，更名梦晨，12年时间很快过去。这期间，汪雨的父亲因想念和自责过度，意外死于车祸。梦晨把这一切的不幸都归结到了继母身上，开始实施报复。而江之冰的回国，给梦晨重又带来了希望。然而慈善院院长的儿子俊诚看到江之冰的到来打破了自己迎娶梦晨的梦，便设计破坏梦晨回到江之冰身边。这期间，江之冰的妹妹江微微认识了颓废的俊诚，俊诚慢慢体会到了爱的真谛，终于放手成全了梦晨与江之冰。获得幸福的梦晨也体会到了继母对她的爱，一家人终于幸福的生活在一起。
钱途，励志要成为中国最好的电视节目主持人，站在春晚的舞台上。然而，时运不济，十多年的拼搏不仅没能让他走向成功，老婆凌秋叶还带着儿子钱多多离他而去。吴靓经历了一场失败的恋爱，把原因归咎于父亲的强加阻拦和“囚笼”般的管束。分手后，她发现怀孕了，对爱情、婚姻失望的她，决定要把孩子生下来，做一个完整的女人，也是对父亲无声的抵抗。钱途与吴靓一拍即合，两人在民政局领了结婚证。钱途借助吴靓北京人的身份，以此来实现跟秋叶复婚，给儿子买房，落户北京的愿望。钱途则负责为吴靓掩盖未婚生子的假象，逃离父亲的束缚。这对“假夫妻”向着各自的目标前进，却屡遭父母、亲朋的猜忌、误解与质疑，在人生的低谷中，两人抱团取暖，逐渐产生了感情。在吴靓的启发下，钱途明白了父爱的责任不仅仅是为儿女获得物质上的拥有；而钱途也让吴靓理解了，父亲的管束源于他伟大的爱，从角色的互换到彼此理解，最终，他们取得事业的成功，也获得了新的爱情。
天宫武财神（陈浩民 饰）受玉帝（卢勇 饰）差遣，奉旨下凡普度众生，不料遭蟾族陷害追杀，被化成人形的小狐狸（穆婷婷 饰）搭救。他因此与雪山巫女、小狐狸和贪心的黒面道士产生了纠纷，双方剑拔驽张，展开了血雨腥风的搏杀。最终，雪山巫女与黒面道士双双气绝身亡。狐王（倪齐民 饰）时年已999岁，再有一年便羽化成仙，他要自己衷爱的女儿九妺（穆婷婷 饰）嫁给金不换（谭耀文 饰），以期将来传位于她，结果遭到八个姐姐的反对与妒嫉。而九妹并不喜欢父王钦点的金不换，她想伺机逃走，看破她心思的狐王把九妺囚禁了起来，九妹冲破金不换的层层设防，最终走向自由。樵夫刘枫（陈浩民 饰）偶遇落难的九妹，两人一见钟情……
出生于传统裁缝世家的哈蕾从小梦想成为芭蕾舞者，可缺少天赋的她始终被周围人认定是“飞不起来的丑小鸭”。机缘巧合下哈蕾进入联涟娱乐集团成为一名练习生，与刚出道的偶像男团MY同属一家公司。完全没有街舞功底的哈蕾为了追求自己的舞蹈梦想，不停的拼命练习，被一向倔强自大的男团队长赫连荣光看在眼里，决定帮助这个“丑小鸭”。荣光有着惊人的舞蹈天赋，人人都羡慕他“天生的”才华，却不知其实他身上隐藏着一个巨大的秘密…… 脑中植入的一枚芯片每十年都需要重新唤醒一次，这会抹除他这十年间的所有记忆。明知自己会忘记，是否还要开始一份爱？
年过三十的都市大龄女余诺诺（黄小蕾 饰）面临着生活、感情双受挫，在将与男友周桐（张竞达 饰）结束爱情苦旅时，周桐却重创了诺诺的心，诺诺一气之下与偶然邂逅的杜晓昂（吴军 饰）闪婚。一心想嫁入豪门的妹妹余沫沫（贾青 饰）偶遇富家公子马林（林申 饰），马上对其展开了凌厉的攻势。周桐得知诺诺转嫁他人，寻衅上门，在推桑中致怀孕的诺诺流产。远在农村的公婆找上门来，结果，双方亲家一见面，就闹了个不欢而散。马林的母亲程小英（高宝宝 饰）看准沫沫是为马家的财产而来，极力阻挠，可铁了心的马林威胁母亲，若不同意他将倒插门。沫沫的父亲余远志（姬麒麟 饰）和母亲王莉（吴冕 饰）被迫答应两人试婚。同居之后，马林和沫沫充分暴露了各自的真实本性。妹妹这样，诺诺又能过成什么样呢......
西南某灾区迎来了救援医疗队和志愿者们，随队而来的还有女演员秦翡。人人都说秦翡来当志愿者不过是为了作秀，然而，秦翡却认真努力，还在危急时刻舍身救人。日夜相处中，医疗队队长行知止看到了秦翡内心的坚韧和善良，两人加深了彼此了解。秦翡也发现多年前自己参加舞蹈比赛时遭遇意外，在危急时刻救了自己的命、也令自己重燃希望的年轻医生正是行知止。他们的缘分在很早之前就已经结下。两人在生活中相互扶持，在事业上各自努力，行知止再次参与重要救援任务，秦翡凭借努力重新获得大众认可。秦翡对行知止说，你以生命救援生命，你答应过我，平安归来，你说的话我都相信，哪怕谎言也动听。
淄城琉璃行会长张福海身怀绝技葡萄凝霜，为防技艺失传公开招徒。青年宋凯脱颖而出，却暗中与张福海的对手章大成勾结，利用偷学的技艺助其赢得琉璃争霸赛，并意图当众毁掉张福海的招牌。关键时刻，宋凯的母亲林飞红现身，揭露尘封多年的真相。两代人的爱恨纠葛因琉璃技艺的传承与背叛层层展开，最终在误会解开后迎来和解。与此同时，意大利留学生玛利亚寻访祖父辈的跨国琉璃情缘，让一段因援建任务而错过的爱情在晚年重圆。故事以琉璃艺术节为高潮，老一辈的遗憾得以弥补，新一代的宋凯则肩负起创新琉璃技艺的使命，展现了传统工艺在新时代的蓬勃生机。
严林（周惠林 饰）是狙击手训练队的总教官，手下有两个优秀的学生——韩光（傅程鹏 饰）和蔡晓春（孙逊 饰），他们即是患难与共的兄弟也是竟争中的对手，而且还同时爱上了军医赵百合（杨舒 饰）。在一次行动中，蔡晓春因违犯军纪被开除军籍，赵百合和他一起离开了部队，后来听说他出国沦为雇佣兵。五年后，已是功勋狙击手的韩光转业到滨海，他的专用狙击枪神秘被盗，而赵百合则被这支枪猎杀，韩光成了被通緝的杀人疑犯。就在这时，蔡晓春离奇出现在滨海，他受黑手何世荣（宁晓志 饰）雇佣，准备猎杀海外财团老总何世昌（赵之连 饰）。就这样，当年的战友加兄弟，韩光和蔡晓春将展开一场生死对决……
本剧将延续《家有爹娘》第一部的整体风格，继续讲述王家三世同堂的情感故事。该剧以贴近百姓生活、反映当下社会现状，展示普通人婚姻状况和家庭情感的现实生活为出发点，通过表现价值观念与生活背景迥异的两代人对生活各自不同的态度，显示出极强的现实意义。 王家二媳妇田一的怀孕重新点燃了王起孟（张炬饰）抱孙子的希望，全家人为小生命的到来积极做着准备，然而两代人对怀孕的不同想法也造成了不少误会。随着一个漂亮孙女的诞生，王起孟却郁闷得病倒了……侯淑云（严敏求饰）和王起孟商量，想让前大儿媳刘颖、孙女兰兰、外孙女小桃早日结婚，为他们生个男孩续接香火。 英俊洒脱、才华出众的服装设计师王学兵（张智尧饰）欣赏公司女老板刘颖（朱琳饰）的气质和美丽，穷追刘颖。刘颖犹豫再三，终于鼓起勇气接受这份难得的爱情。当他们就要宣布结婚时，刘颖却发现自己的女儿兰兰一直暗恋王学兵。母女俩爱上同一个男人，令她们陷入感情的痛苦煎熬中，也让王家上下闹翻了天。经过一段时间痛苦的折磨，兰兰和刘颖都把对方的幸福看成是自己最大的幸福，刘颖拒绝了王学兵的爱情，兰兰则决定同男友秦海订婚。在兰兰和秦海的订婚仪式上，王起孟兴奋地催兰兰快要孩子，可是秦海却回答他不想要孩子……
遭受打击对生活失去信心的中年男子张大宝（张维伊 饰），意外回到年轻时的1995年，遇到了22岁的自己，在经历了一系列碰撞之后，两人决定携手弥补旧日遗憾，重塑全新人生。
