科技罪案组高级督察司徒忠（杨明饰）、督察萧美婷（陈晓华饰）在工作上亦师亦友，屡破各种电话、网络、科技骗案；司徒忠在侦查一宗网上情缘案件的过程中，重遇前度女友张慧（高海宁饰），碰巧她与丈夫沈子浩（黄祥兴饰）关系破裂，司徒忠与张慧爱火得以重燃……美婷及后误令家人被骗财，情绪大受打击，幸得司徒忠从旁扶持，重新站起。与此同時，伦敦金骗案闹得满城风雨，而子浩与张慧亦牵连其中，危机四伏；骗案其实由势力庞大的集团控制，幕后主脑更是欺骗美婷家人的匪徒……司徒忠与美婷携手并肩，誓要将骗徒绳之以法。
华裔女队长魏晓晨带领特警队，捣破人口贩卖集团基地，发现一具女性尸体，竟然是孪生妹妹梁曦，晓晨悲痛欲绝，发誓要用余生追查妹妹被杀真相。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
本剧中所涉及的故事有一半根据真实的个案改编。 香港红十字会寻人服务组“恩明社”专为青少年、长者提供各类型社会服务，其中还成立了一个「寻人服务组」，专责替人寻找因战乱、天灾、搬迁或是家庭突变而失散的亲人。进取求好的康如枫（钟嘉欣 饰）、乐天积极的施亦谦（陈智燊 饰）、贪玩 精灵的冼洁贞（乐瞳 饰）、清贫电脑仔杨子基（陈伟洪 饰），在冷静理性的组长鲁文迪（蒋志光 饰）领导下，开展一个又一个艰苦的寻人历程。五个不同背景和性格的人怀著同一信念，尽最大努力让求助人与失散亲人团圆相聚。替别人寻回幸福的同时，他们亦经历了重新检视自我的过程……
佩佩（陈秀雯 饰）自从婚后就尽心尽力当一名合格的全职主妇，相夫教子。这些年来和丈夫阿礼（姜大卫 饰）一直相敬如宾，一对子女亦聪明伶俐，可以说是外人眼中的模范家庭。然而，佩佩这些年来忙于照顾家庭，却一直忽略了自身的修饰和提高，导致阿礼面对佩佩时感到十分无味。一次，阿礼邂逅 了美艳女星卓羚，开始了一段婚外情。阿礼越陷越深，最终决定和佩佩离婚。直到这时，佩佩才知道这一残酷的现实。这一打击令她十分消沉，失去了家庭令似乎她失去了所有的依傍，幸亏这时好友汤敏蓉（邓萃雯 饰）及洪世亮（林伟 饰）不断鼓励和开解她，她才慢慢的振作起来。 在好友的帮忙下，佩佩逐渐走出婚姻失败的阴影，她亦开始接受了这次失败的教训，努力改造和提升自己。经过一番努力，佩佩顿时变得明艳动人，更与英俊潇洒的医生子儒（陈启泰 饰）打得火热。另一方面，阿礼与卓羚激情消退后，又开始想念以前那温馨的家了……
初一箭（黄浩然 饰）自小就失去了父母，是孤苦无依的孤儿。幼年时的一段经历让他立志成为捕快，并且最终完成了这一梦想。初一箭在职场上的锋芒毕露让捕头程英雄（杨明 饰）感到十分不快，于是他利用职务之便故意指使初一箭去追捕穷凶极恶的尹天邦（麦长青 饰），希望此行能让初一箭吃一吃苦头。 之后，初一箭结识了女贼欢喜（黄翠茹 饰），身份对立的两人如同前世冤家一般水火不容，然而，欢喜却屡屡救初一箭于命悬一线之中，更和欢笑（乐瞳 饰）和欢静（梁嘉琪 饰）姐妹三人重演了梁山伯与祝英台之故事，希望能借此获得初一箭的注意。可是，半路杀出的千金小姐蝴蝶（陈自瑶 饰）将欢喜的如意算盘破坏殆尽，初一箭陷入了和蝴蝶的感情漩涡之中无法自拔。
楚帆（陈锦鸿 饰）和楚慈（吴卓羲 饰）俩父子虽然生活在同一时代，可内心所处的时代却相隔颇远。楚帆依旧怀念着过去六十年代的旧时光，怀念那个时候的人情世故；而楚慈只觉得当下依然还不够快。在烟草公司工作的楚慈可谓如鱼得水，口齿伶俐的他职位升了又升，薪水加了又加。可作为父亲的楚帆却看不过去，后来楚帆患上了老年痴呆，楚慈不得不加以照料。 阴差阳错间，楚慈竟然穿越到了父亲生活的六十年代！父子一下成为了兄弟，故事的舞台是当年的云吞面馆，还有形形色色的租户。起初颇不适应的楚慈该如何应对这突发状况，而父子俩的关系又当有何发展……
故事发生在清朝康熙年间，忠臣何大人遭到奸人所害，沦落到全家抄斩的境地。其女玉凤（黄杏秀 饰）为了救父亲勇闯法场，虽然连砍了刽子手十三刀，但依然不敌对方身强体壮，虽然没能救得了父亲，但是玉凤得到了“十三妹”的江湖绰号。 安骥（汤镇业 饰）是玉凤的青梅竹马，亦和玉凤有着相似的遭遇，同仇敌忾的两人结伴行走江湖，发誓为他们的家人报仇。一次偶然中，两人遇见了康熙的妹妹双格格（翁美玲 饰），双格格在误打误撞之中爱上了女扮男装的玉凤，期间闹出了不少的笑话。实际上，双格格的真实身份早就被九难师太（李琳琳 饰）给识破了，她打算利用双格格来完成她刺杀康熙的大业。
常浩琛、殷善美夫妻是一个典型香港中产家庭，有车有楼也有一对聪明可爱小朋友，十分令人羡慕。琛经营电脑生意，努力赚钱，把心力时间都押在生意之上。而美一方面担当贤妻良母的角色，另一方面则背着琛又炒楼，又搞美容生意，投资有道。可惜好景不常，经过金融风暴、科网爆破、911事件等令琛与美的生意一落千丈，但琛因为不想美担心，竟半句也不说，独自死撑下去。而美亦一心想撑至最后底才告诉丈夫，结果一天，双方的经济危机同时爆破！ 美在经济困难的日子曾向契妈娇借钱，破产后，娇的女儿尹小玲认为母亲的血汗钱被美所骗，对琛夫妇恨之入骨，誓替母亲讨回旧债。玲是一名女CID，性格豪爽，表面上是男人头差婆，但骨子里恨嫁非常，直至玲遇上了风流倜傥的律师─伍文昌。 当破产的日子开始后，琛一家人需重新适应新生活，首先大屋搬细屋，接着是琛去重新打工。琛赫然发觉人浮于事，且不乏大学生、硕士之流，琛始真正惊觉时势已变。期间，美有一毕意外之财，正当美满心欢喜之际，琛因误会而擅作主张地把奖金上缴破产管理处，导致夫妇间大吵一顿，二人亦终于决裂，正式分居！ 与此同时，当玲暗中监视和调查琛时，碰上琛好友昌。昌能言善辩，得势不饶人，使玲对昌又爱又恨。渐渐地玲发现昌不为人知的一面，昌虽出身大户之家，却是在家族中最被看不起的一个，因此玲也开始对昌改观，更由欣赏变为倾慕，二人更发展出一段情缘来。 昌一直喜欢玲的真性情，玲也为二人感情发展，努力改变自己，装作温婉可人，吃了不少苦头。但当二人关系稳定后，玲渐觉与昌相处，有很大压力，加上昌父横加插手，不愿昌娶一名女警，要令玲自卑心作祟，主动和昌分手。怎料昌失去后更觉玲可贵，且一改大男人要面子性格，努力把玲追回。 琛和美分居后仍然想念对方，但因为种种巧合与误会，令琛和美多次错失了复合机会，一天，祖竟然向破产处告发美一直以来的秘密享受！琛方知道原来祖并非同性恋，他对美原来戏假情真，示爱不果竟因爱成恨。到底琛能否救美于水深火热之中！而琛、美二人的婚姻关系又能否和好如初？
丁一山（洪永城 饰）拥有一条无人能及的舌头，其味觉要比常人灵敏百倍。虽然天赋异禀，但奇怪的是丁一山的父亲却明令禁止儿子从事厨师相关的职业。某日，状元楼举行厨艺大赛，丁一山瞒着父亲和好友石柔（蔡思贝 饰）前往参赛，虽然最终两人因为种种意外丢掉了冠军的头衔，但丁一山的特殊能力受到了名厨盖兆天（黄子恒 饰）的认可和赏识。 盖兆天虽然拥有着精湛的厨艺，却始终无法研究出创新的菜式。在丁一山的帮助下，盖兆天终于突破了自我，一时间状元楼名声大噪，丁一山亦成为了著名的美食家。丁一山和盖兆天惺惺相惜，可两人的友谊却因为石柔的存在而产生了裂痕。
郎朝勇、貝競枝由合作經營劏房到開設地產代理公司，再由最佳拍檔結成夫婦，成為在公在私的合伙人。然而對自小單打獨鬥的競枝來說，經營一個家庭比一盤生意來得冒險，事關這意味她要包容朝勇的全家－自卑的小叔朝仁、戀上花花公子邢呇的小姑朝信等。還好朝勇深愛競枝，不惜替她頂罪入獄。公司危機湧現，競枝不想朝勇出獄後一無所有，利用女兒設計投靠前男友邢呇。只是競枝貪念氾濫，最終拆伙收場！愛得真、恨得深，兩人從此反目成仇…
陈三元（滕丽名 饰）晋升为见习督察，被调到了交通部。初为上司的她严于律己之外，对下属也有十分高的要求，因此三元很容易与下属发生磨擦，与刚进入交通部的卫英姿（蔡少芬 饰）也合不来。自小受父亲卫英雄（夏雨 饰）的影响，英姿一直很喜欢风驰电掣。在一次追捕飞车党的过程中，面对狡猾的飞车党幸得英姿精湛的车技，与三元一起将飞车党绳之于法，二人更冰释前嫌，成为了工作上的好拍档。 由于三元一直忙碌工作，忽略了丈夫与儿女，丈夫程锋（魏俊杰 饰）开始时也是十分体谅的，但随后面对三元的变本加厉，夫妻俩只好分局收场。但他们在工作中还是有很多合作的机会，而他们的女儿正好在一次械劫案中被歹徒挟持做人质了，面对年幼的女儿，二人合力拯救了女儿。 英姿被上司误以为飞车而被调到陈小生（欧阳震华 饰）所带领的特遣队，小生与英姿都觉得对方是自己的克星，常常斗气。后来英姿在失意的时候得到了小生的多番安慰，渐渐培养出了感情，但此时父亲英雄却嫌弃小生比英姿大很多而反对这段恋情，两人的关系进退两难……
