第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。
每一个生命的结束也有背后的原因。无论怎样隐藏、怎样毁灭证据，真相永远存在，甚至由死去的揭发。可幸警队中有一个部门，为着看不到的真相而努力，他们用尽所有方法，甚至与死亡近距离接触，让罪有应得的人得到报应。这里就是——鉴证科。 鉴证科探员高达(黄日华饰)利用尸体身上遗下的蛛丝马迹，利用现今各种高科技，为死去的人伸冤，屡破奇案。但，高达却是个怪人，他本为重案组干探，因好赌成性欠下巨债，被迫接受警队内部调查，调职往鉴证科充当文职工作。自六岁那年亲眼目睹死亡开始，他与不可解释之事总是扯上关系。 调职关系，高达来到新环头。怎料重案组的上司正是来自被外界称为神怪之地的‘古董仓’，于仓中‘过冷河’的前卧底警员关蜀勋。同时，高达需要接受心理医生的治疗，达的医生，正是刚当上警队心理医生的李嘉雯(李姗姗饰)。达不知眼前人正是当年被牵入‘古董仓’鬼怪事件的医生。 三个天生与疑幻疑真有着奇妙联系的人走在一起，环头警署自始发生一宗又一宗的灵异案件……
可云的爸爸政爱上了可云的妈妈，一个来自菲利宾的华人，可是却得不到政家人的同意，因为，政的家人希望政可以聚一个有钱人家的女儿...可云的妈妈知道自己有病，而这个病能不能治好，谁也无法确定!于是，为了政的将来，她在怀着可云的时候，悄悄的消失在政的眼前...政并不知道时尚女性她怀了可云，只是以为她变了心，抛弃了自己……
重案组高级督察韦景声和香港廉政公署高级调查主任贺伟廉在缉凶过程中不期而遇，几经被赃款陷害、杀手追杀，搭档反目后，携手使一个几乎包含了整个香港顶层社会网络的贪腐势力逐渐浮出水面，据悉，该剧有九大案件贯穿始终，且部分案件是由真实事件改编 。
张伟杰（梁朝伟）在警界服务多年，屡建奇功，因此获调派往严重罪案调查科。杰办案时认识了退隐江湖的车房老板边城（高雄），两人惺惺相惜，成为知己。惟城逼于情势而重投黑社会，与杰为敌。 另方面，杰的婚姻亦起风波，妻子叶巧宜（曾华倩）提出离婚，而清新可人的酒廊歌手程月如（邓萃雯）此时闯进杰的生命中…… 时两大黑社会巨头郑康贵（光毅）、卓寿贤（鲍方）展开恶斗，杰受命铲除两帮势力，却因而连累了宜…… 一连串冲击接踵而来，杰将如何面对？
周慧婷（陈心妤 饰）和周慧青（周均谚 饰）是一对情同手足的姐妹，彼此之间感情十分要好，周慧婷身为长姐处处照顾周慧青，而周慧青则更是依赖着姐姐，不允许任何男人靠近。阿义（张维锡 饰）的出现让周慧青心中亮起了警灯，为了阻挠他和姐姐之前的关系，周慧青连蒙带骗的带着阿义去拜了兔儿神（陈威翰 饰）。 两人没有想到的是，他们竟然就此被吸入了兔儿神所统治的世界之中，在那里，男人和男人在一起，女人和女人在一起，异性恋被视为异端，会遭到兔儿神的惩戒，这可乐坏了一心想要霸占姐姐的周慧青。在这个世界里，阿义叫苦连连，因为他的结拜大哥竟然对自己展开了热烈的追求。
能够成为一名对社会有用的人一直都是张志杰（梁朝伟 饰）的理想，长大成人后，充满了正义感的他选择成为了一名警察。在与女友谢颖芝（张曼玉 饰）分手后，志杰接受了林佩贤（黄造时 饰）的追求，两人走到了一起。 倪峰（刘青云 饰）是志杰的师兄，一次意外中，由于志杰的疏忽，倪峰遭遇 了车祸身负残疾，自暴自弃的他离开了警队，淡出了众人的视线。志杰有一同父异母的兄弟名为家明（戴志卫 饰），与志杰是同行，最近，家明因被卷入一宗诈骗案之中而遭到了追杀，杀手不是别人，正是消失已久的倪峰。家明死了，凶器竟然是志杰的配枪，志杰因此亦被卷入案中。为了证明自己的清白，志杰开始了对案件的调查。
丽晶（陈松伶 饰）的感情之路走得向来磕磕绊绊，意外良多。在经历过千难万险之后，她终于即将和男友携手步入婚姻的殿堂，这成果着实得来不易。然而就在结婚当天，男友竟然做了落跑新郎，而这一切的始作俑者，是一个名叫庄富豪（张兆辉 饰）的男人。在误打误撞之中，丽晶应聘成为了庄富豪所居住的酒店的房务，两人不打不相识，随着时间的推移竟然渐渐生出了感情，然而他们的身份和地位相差甚远，丽晶是否有足够的勇气去接收这段感情呢？ 缪思（陈滢 饰）靠着男人过活大半辈子，终于明白自己才是最可靠的所在，于是来到了酒店成为了实习生自力更生，就此结识了太子爷庄隽颖（张振朗 饰），两人牵扯出一段剪不断理还乱的复杂恋情。
明晓溪（曾沛慈 饰）是一位淳朴善良的农村女孩，以武术特长生的身份进入了大学深造，哪知道入学的第一天就惹上了大麻烦，更招致了学生会会长牧流冰（林子闳 饰）的轻视和不满。牧流冰要明晓溪为自己的所作所为道歉，但倔强的明晓溪断然拒绝，她还和牧流冰约法三章，如果自己不能证明自己的成绩配得上这所大学，就主动退学。 明晓溪和牧流冰都参加了学校的爱心社，在此过程中，明晓溪的单纯和善良渐渐吸引了牧流冰的注意，牧流冰亦通过行动改变了自己在明晓溪心目中纨绔子弟的形象，两人之间渐渐产生了真挚的感情。可是，他们的感情却遭到了牧流冰家人的强烈反对，在巨大的压力之下，两人还能够不忘初心，坚持下去吗？
天界老祖与魔界熬星为星宿化身相斗了千万年，最终以熬星落败、被天锁所困而告终。熬星元神出窍，乘烈火至尊走火入魔这际投入其体内并控制了他，终日苦练“九星连球”，以破天锁之困，而至尊亦可多活二十年。至尊得元神之力，消灭了对头桃园王而成为一代霸主，而桃园王之子韦天宝，借天界元入窍之助，寻得神剑，并拜丁一、卜冠一为师，学成左门遁甲。更难得的是他喜欢上至尊之女易寒烟，互生情义。烟虽孝顺，但知父被煞星元神所控，便不惜助宝大义灭亲。 另外宝得红颜知己及红珊瑚之力，成为避难山庄庄主，而后又因平定圣剑门内乱被举为门主。至于桃园王属下天哭，天伤晴中建立小桃园，亦为宝增加对抗天尊的实力；宝得避难山庄，圣剑门、小桃园之力，千辛万苦兽胜烈火至尊。然而，此时煞星己练成九星连珠，元神归窍后破天锁而山，真正的战斗才刚刚开始……
Jackie（蔡少芬 饰）罹患脑癌后一直昏迷，程至美（吴启华 饰）一直守候照顾。至美的用情专一深深感动了同一所医院的医生何心研（蒙嘉慧 饰）。富家女出身的心研跟风流医生林敏智（陈豪 饰）本是恋人，遇上了至美才让她看到了细水长流的爱情。 江满月（苏永康 饰）因爱滋病逝世，姐姐新月（陈慧珊 饰）伤心欲绝，黎国柱（林宝怡 饰）在身边给予安慰，两人之间的爱情再次滋生。好景不长，国柱与助手阮朗平（陈洁仪 饰）日久生情了。朗平后来觉得对新月十分歉意，独自离开了香港。不久国柱知道朗平怀孕了，便推测自己是否孩子的父亲，情急之下把真相告诉了新月……
东洋武士 为剑道而生 正义之士 为武林而战！ 东洋武士无名客，毕生研习剑道。远涉重洋，来到中原，挑战各大门派，先后击败无数武林高手，杀戮甚众，迫使已隐居之中原第一剑客离垢居士出手比试，一决雌雄。离垢险胜半招，无名含恨而去，誓言 七年后卷土生来。但垢终被震断心脉而死；临终遗言只有武林秘笈可对付无名。 其时，正邪两派亦争夺以图称霸中原，而引起连番厮杀。 话分两头，南宫世家长子南宫逸天生异禀，拜离垢师兄离尘为师，尽得离垢家传绝学。后机缘巧合，学得凌家剑谱，武功更臻化境。唯因性情闲逸，无意逐鹿中原，隐居山林，潜心武学。 转眼七年已过，无名重复中土，武功更进。所向无适度，且更杨言，必将血洗中原。武林大起恐慌。眼见武林将遭浩劫，南宫逸毅然挺身与无名决一死战。 南海之滨，英雄云集，屏息以待，南宫无名，剑拔弩张。谁胜谁负，未到最后一招也难分解。
多棲藝人兼工作室老闆丁仲堯，以愛妻號形象走紅。太太林采琳息影後專注家庭，陪子女赴海外升學，忍受夫妻分隔異地之苦。采琳秘密回港與仲堯團聚，未料驚喜變驚嚇，仲堯竟對她百般嫌棄……采琳終知悉仲堯寵妻只是人設，得仲堯經理人禾平點醒，決要找回自己價值，惟復出幕前路難行，只好轉當幕後重返職場，無奈服侍早已反目的當紅女星沈洛澄。采琳當年被指介入仲堯、洛澄之間，如今二人似已舊情復熾下，該如何勇敢面對這場婚姻亂局？
